В Анапе хорошо развита транспортная связь между другими городами, как хорошими автодорогами, так благодаря другим наземным, воздушным и водным видам транспорта. Имеется собственный аэропорт международного сообщения, расположенный в 15 км от центра города, железнодорожный вокзал, расположенный в 7 км от центра, и автовокзал, расположенный в центре Анапы на начале улицы Красноармейской. А в начале улицы Ленина располагается морской пассажирский порт, способный принимать суда малотоннажные.

Также в 33 км от города располагается железнодорожная станция Тоннельная (поселок Верхнебаканский) Юго-Восточной железной дороги с поездами, движущимися на Новороссийск и обратно. Пассажиры от станции в Анапу доставляются рейсовым и автобусами или такси.